По своему статусу прокуратура приравнена к прокуратуре субъекта Российской Федерации. В её состав вошли восемь межрайонных природоохранных прокуратур, которые расположены в городах Братске, Иркутске, Усолье-Сибирском, Усть-Илимске и посёлке Еланцы Ольхонского района Иркутской области, городах Улан-Удэ и Северобайкальске Республики Бурятия, а также в городе Петровске-Забайкальском Забайкальского края.

Природоохранная прокуратура осуществляет надзор за исполнением законов об охране окружающей среды и природопользовании, соблюдением прав граждан на благоприятную окружающую среду, за межрегиональными, территориальными органами и подразделениями федеральных органов исполнительной власти, органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации и местного самоуправления, коммерческими и некоммерческими организациями (в том числе управляющими особо охраняемыми природными территориями и особыми экономическими зонами туристско-рекреационного типа) на территории регионов, расположенных в Байкало-Ангарском бассейне.

Надзорная деятельность межрегиональной прокуратуры началась с 1 февраля 2018 года.

Межрегиональной природоохранной прокуратурой с момента образования выявлено более 30 тысяч нарушений законодательства в сфере охраны окружающей среды и природопользования, для их устранения принесены 1296 протестов, внесены 5185 представлений, в суды направлены 2446 исковых заявлений (заявлений), предостережены о недопустимости нарушения закона 626 должностных лиц, в порядке пункта 2 части 2 статьи 37 УПК РФ в органы предварительного расследования направлены 238 материалов проверок для решения вопроса об уголовном преследовании. По результатам рассмотрения мер прокурорского реагирования взыскано более 3 млрд рублей, к административной и дисциплинарной ответственности привлечены 2830 должностных и юридических лиц.

Байкальская межрегиональная природоохранная прокуратура создана для охраны озера Байкал и его уникальной экосистемы, поэтому надзор за исполнением законодательства об охране вод является основным для прокуратуры.

В целях снижения количества сбросов неочищенных стоков в водные объекты прокуратура добилась проектирования более 30 очистных сооружений на Байкальской природной территории.

Только по результатам комплекса мер прокурорского реагирования в 2020 году впервые за несколько лет в бюджетах Байкальских регионов заложено финансирование на проектирование и строительство (реконструкцию) очистных сооружений на сумму 671 млн руб. (Республика Бурятия – 90 млн руб., Забайкальский край – 9 млн руб., Иркутская область – 572 млн руб.).

Построены и введены в эксплуатацию современные очистные в посёлках Выдрино и Максимиха, завершается реконструкция очистных сооружений в Иркутске и Улан-Удэ.

В результате принятых мер удалось добиться сокращения объёмов сбрасываемых загрязнённых сточных вод на Байкальской природной территории на 104 млн куб. м.

По иску прокурора из незаконного владения частного лица истребован в федеральную собственность водный объект – озеро Личимо, имеющее гидрологическую связь с озером Байкал.

В 2021 году завершено определение границы береговой линии озера Байкал и его главного притока – реки Селенги. Протяжённость поставленной на учёт береговой линии водных объектов в Иркутской области и Республике Бурятия составляет 13,6 тыс. км, из которых 2,1 тыс. км – озера Байкал.

По иску Восточно-Байкальской межрайонной природоохранной прокуратуры с должностного лица администрации г. Улан-Удэ взыскивается ущерб в связи с утверждением некачественной проектной документации по реконструкции правобережных очистных сооружений канализации г. Улан-Удэ в рамках реализации национального проекта «Экология».

В сфере охраны водных биологических ресурсов межрегиональной природоохранной прокуратурой принятыми мерами обеспечено восстановление биомассы одного из главных символов Байкала – байкальского омуля. Федеральным государственным бюджетным учреждением «Главрыбвод» впервые в 2018 г. заложено на инкубацию 520 млн экземпляров икры омуля, что в 5 раз выше показателей прошлых лет. В дальнейшем эти показатели только росли: в 2019 году – 670 млн, в 2020-м – 852 млн, в 2021-м – 820 млн, в 2022-м – 1027 млн экземпляров.

В результате принятых мер уполномоченными органами обеспечена надлежащая охрана нерестового стада. На сегодняшний день после завершения нереста объём ската личинок омуля по р. Селенге в озеро Байкал составил 1,2 млрд шт. Данный показатель равен общему объёму ската за последние 5 лет, что свидетельствует об увеличении биомассы омуля в озере Байкал и его притоках.

Байкальская природная территория и бассейн реки Ангары богаты лесными ресурсами. Учитывая большую площадь лесного фонда, высокий объём заготавливаемой древесины, надзор за исполнением законодатьельства в сфере лесопользования является для Байкальской межрегиональной природоохранной прокуратуры одним из приоритетных.

В ходе надзорной деятельности в Иркутской области выявлена незаконная схема вырубки здорового леса под видом санитарно-оздоровительных мероприятий – сплошных санитарных рубок. На всей поднадзорной территории в результате прокурорского вмешательства запрещены сплошные рубки лесных насаждений в защитных лесах, в том числе в расположенных на особо охраняемых природных территориях.

По искам Братского природоохранного прокурора с четырёх организаций взыскан ущерб в размере более 2,4 млрд руб., нанесённый лесному фонду рубкой в ценных лесах под видом санитарной рубки.

В Республике Бурятия межрегиональной природоохранной прокуратурой на землях лесного фонда в Центральный экологической зоне озера Байкал с учётом введённых законодательством ограничений прекращены рубки леса по действовавшим на протяжении 10 лет договорам аренды лесных участков. Принятыми мерами удалось сохранить более полутора миллионов гектаров особо ценного леса на побережье озера Байкал.

В результате принятых межрегиональной прокуратурой мер во всех поднадзорных Байкальских регионах активизирована деятельность органов лесного хозяйства и лесопользователей по проведению лесовосстановления в рамках реализации федерального проекта «Сохранение лесов» национального проекта «Экология». В Иркутской области увеличено количество лесопитомников (с 1 до 11), а также выросли темпы лесовосстановления​ (со 139,7 тыс. га в 2019 г. до 157 тыс. га в 2021 г.), в Забайкальском крае в границах Байкальской природной территории – с 4,8 тыс. га в 2019 г. до 9,3 тыс. га в 2021 г. èèè

Введены в действие материалы лесоустройства на площади 4,5 млн га.

Принятые надзорные меры позволили положительно повлиять как на динамику незаконных рубок, количество которых снизилось на 48% (с 1985 до 1031), так и на размер причинённого государству ущерба, который сократился почти в 2 раза (с 4,3 млрд руб. до 2,6 млрд руб.).

В результате наступательной и системной работы прокуратуры, своевременного принятия мер превентивного характера до начала пожароопасного периода сокращено количество пожаров на поднадзорной территории с 2610 в 2019 году до 1458 в 2022 году, также в 10 раз сократилась площадь пострадавших от пожаров лесов (с 2400 тыс. га в 2019 году до 240 тыс. га в 2022 году).

По искам межрегиональной природоохранной прокуратуры лесопожарные станции укомплектованы необходимым для тушения лесных пожаров оборудованием.

Особо охраняемые природные территории – это одна из главных ценностей Байкальской природной территории. В результате системной работы межрегиональной прокуратуры во взаимодействии с Генеральной прокуратурой Российской Федерации ФГБУ «Заповедное Прибайкалье» поставлены на кадастровый учёт границы самой протяжённой ООПТ в стране – национального парка «Прибайкальский».

По требованию межрегиональной прокуратуры в 2022 году правительством Иркутской области приняты меры к созданию единого органа, осуществляющего функции по управлению особо охраняемыми природными территориями регионального значения.

В исполнение мер прокурорского реагирования межрегиональной прокуратурой возвращено в государственную собственность более 1 тыс. га земель, имеющих особую природную ценность, из которых 663 га – особо охраняемые природные территории.

Наличие высокой антропогенной нагрузки на природные объекты повлекло за собой необходимость регулирования в сфере туризма.

По требованиям межрегионального природоохранного прокурора в Республике Бурятия, Забайкальском крае и Иркутской области разработаны правила организации туризма и отдыха, обязанность принять которые возникла у органов исполнительной власти регионов ещё 20 лет назад. В результате данной работы владельцами наиболее крупных объектов рекреации разработаны экологические паспорта, предусматривающие в том числе максимальную численность постояльцев, накопление и вывоз отходов, природоохранные мероприятия.

Проводится и работа в сфере обращения с отходами производства и потребления. Принятые Байкальской межрегиональной природоохранной прокуратурой меры способствовали разработке проектной документации на строительство 4 полигонов твёрдых коммунальных отходов, 2 мусоросортировочных комплексов, ликвидации 175 свалок отходов, в том числе 10 тонн опасных отходов – литиевых батарей в природном парке «Птичья гавань».

В результате комплексной и системной работы Байкальской межрегиональной природоохранной прокуратуре удалось организовать действия Министерства природных ресурсов и экологии России, правительства Иркутской области по ликвидации промышленных площадок бывших «Усольехимпрома» в г. Усолье-Сибирском Иркутской области и Байкальского целлюлозно-бумажного комбината в г. Байкальске Иркутской области. В настоящий момент территория промышленной площадки в г. Усолье-Сибирском фактически очищена.

В рамках реализации национального проекта «Экология» по результатам надзора обеспечена закупка контейнеров для раздельного сбора отходов, ликвидированы крупные свалки на землях особо охраняемых природных территорий. Обеспечено строительство очистных сооружений в г. Улан-Удэ, г. Иркутске, Забайкальском крае.​

Под постоянным контролем Байкальской межрегиональной природоохранной прокуратуры находятся вопросы охраны атмосферного воздуха, в том числе достижения целевых показателей федерального проекта «Чистый воздух» национального проекта «Экология».

Благодаря реализации запланированных мероприятий объём выбросов загрязняющих веществ в атмосферный воздух в Иркутской области сократился с 953 до 894,9 тонны (на 6%). Активизирована работа уполномоченных органов контроля (надзора) по постановке на учёт объектов негативного воздействия на окружающую среду.

Хозяйствующими субъектами оснащены газоочистным оборудованием 19 источников выбросов загрязняющих веществ в атмосферный воздух.

В результате прокурорского вмешательства выделено 1,8 млрд рублей на цели, связанные с выведением из эксплуатации в г. Иркутске устаревших теплоисточников (18 мазутных и угольных котельных).

По инициативе Байкальской межрегиональной природоохранной прокуратуры 11 городов с высоким уровнем загрязнения воздуха включены в эксперимент по квотированию выбросов загрязняющих веществ в атмосферный воздух.​

Площадь охотничьих угодий на поднадзорной территории составляет почти 70 млн га. Основными и наиболее значимыми объектами охоты в пределах Байкальской природной территории являются копытные (благородный̆ олень, кабарга, косуля, лось) и пушные виды животных (соболь, горностай, норка).

Мерами прокурорского реагирования с лесозаготовителей взыскан ущерб животному миру в размере 115 млн руб. В Иркутской̆ области пресечены факты необоснованного увеличения лимитов добычи кабарги за 12 лет.

По искам межрайонных природоохранных прокуроров возложены обязанности по проектированию особо защитных участков лесов в районе глухариных токов и мест отёла, признана запрещённой информация о применении средств добычи животных.

Увеличен объём финансирования на ведение Красной книги Республики Бурятия на 2022-2023 гг. до 12,5 млн руб.

По мерам прокурорского реагирования пресечены нарушения прав предпринимателей при оказании государственных услуг, взаимодействия в рамках контрольных (надзорных) мероприятий, технического присоединения, а также реализации инвестиционных проектов, обеспечена надлежащая информационная поддержка.

Под надзором межрегиональной природоохранной прокуратуры происходит формирование благоприятного инвестиционного климата в Байкальских регионах. В настоящий момент общий объём планируемых инвестиций в развитие отраслей промышленности в сфере охраны окружающей среды и природопользования составляет свыше 200 млрд руб. Организована работа по формированию муниципальной нормативной правовой базы в целях поддержки предпринимателей.

По мерам прокурорского реагирования перед ними погашены задолженности на сумму свыше 108 млн руб.

Прокуратурой обеспечены снижение административного давления на бизнес, увеличение профилактической роли органов контроля. Количество проверок сократилось в 2 раза, в рамках объявленного моратория проведение проверок сведено к минимуму за всё время работы прокуратуры.

Впервые расследуются уголовные дела, проводятся процессуальные проверки по фактам причинения ущерба государству коррупционными проявлениями.

Прокурорами сформирована устойчивая практика по привлечению виновных должностных лиц к административной ответственности по ст. 19.29 КоАП РФ.

Проверками вскрываются и пресекаются случаи непринятия мер к предотвращению и урегулированию конфликта интересов, в том числе нахождения в прямом подчинении супругов, близких родственников.